Вышестоящей организацией является Управление ветеринарии Воронежской области.

ГУ"Кантемировская рай СББЖ" имеет следующую структуру

Центральный офис ветстанции

Лабораторно-диагностический отдел

Бугаевская участковая ветлечебница

Новомарковская участковая ветлечебница

Новобелянская участковая ветлечебница

Митрофановская участковая ветлечебница

Смаглеевская участковая ветлечебница

Титаревская участковая ветлечебница

Лаборатория ветсанэкспертизы